More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2169 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2169  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 558 aa  1136    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1448  gamma-glutamyltransferase  85.95 
 
 		 564 aa  956    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.699084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2474  gamma-glutamyltransferase  46.96 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4692  gamma-glutamyltransferase  43.93 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1640  gamma-glutamyltransferase  42.38 
 
 		 543 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2313  gamma-glutamyltransferase 1  42.96 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4194  gamma-glutamyltransferase  41.59 
 
 		 543 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  35.07 
 
 		 556 aa  300  5e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  38.7 
 
 		 583 aa  300  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  38.37 
 
 		 587 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 583 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  34.71 
 
 		 556 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  38.87 
 
 		 587 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 583 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  39.18 
 
 		 592 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  37.55 
 
 		 587 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  37.55 
 
 		 587 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  38.37 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  38.37 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  38.78 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 583 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  37.85 
 
 		 587 aa  290  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  34.92 
 
 		 581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 		 594 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  37.28 
 
 		 557 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  34.37 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  33.33 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  34.55 
 
 		 581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  34.37 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  34.55 
 
 		 577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  36.35 
 
 		 580 aa  284  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  34.19 
 
 		 580 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  37.41 
 
 		 586 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  34.19 
 
 		 580 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  34.19 
 
 		 580 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  36.48 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  34.73 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  34.73 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  36.48 
 
 		 587 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  37.75 
 
 		 610 aa  280  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  34.52 
 
 		 619 aa  280  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  38.16 
 
 		 586 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  34.89 
 
 		 599 aa  279  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  34.55 
 
 		 580 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  34.55 
 
 		 580 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  37.23 
 
 		 576 aa  279  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 576 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  34.36 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34 
 
 		 581 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  36.99 
 
 		 588 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  35.99 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  35.75 
 
 		 645 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 		 594 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  37.68 
 
 		 589 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 		 604 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  34.12 
 
 		 581 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  37.41 
 
 		 586 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  35.47 
 
 		 589 aa  273  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  34.19 
 
 		 580 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  34.49 
 
 		 645 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  36.25 
 
 		 583 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  37.25 
 
 		 581 aa  270  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  35.25 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  36.96 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  36.27 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  36.69 
 
 		 584 aa  267  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  34.41 
 
 		 579 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  34.41 
 
 		 579 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  34.23 
 
 		 579 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  34.23 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  34.41 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  34.23 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  35.19 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  34.41 
 
 		 579 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  33.87 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 		 583 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  34.21 
 
 		 593 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  34.54 
 
 		 576 aa  264  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  34.18 
 
 		 583 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  34.05 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  36.06 
 
 		 606 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  34.92 
 
 		 575 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  36.14 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  35.38 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 617 aa  257  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  35.17 
 
 		 576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  35.17 
 
 		 576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  33.88 
 
 		 590 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  35.5 
 
 		 578 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  34.23 
 
 		 575 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  34.56 
 
 		 578 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  34.15 
 
 		 575 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  33.04 
 
 		 590 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 		 570 aa  244  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  34.89 
 
 		 574 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1522  gamma-glutamyltransferase  37.47 
 
 		 589 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  30.74 
 
 		 599 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  34.13 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  33.16 
 
 		 557 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>