More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1640 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1640  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 543 aa  1122    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2313  gamma-glutamyltransferase 1  77.76 
 
 		 546 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4194  gamma-glutamyltransferase  95.58 
 
 		 543 aa  1073    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2474  gamma-glutamyltransferase  59.47 
 
 		 537 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4692  gamma-glutamyltransferase  45.69 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1448  gamma-glutamyltransferase  42.75 
 
 		 564 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.699084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2169  gamma-glutamyltransferase  42.38 
 
 		 558 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 582 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  37.53 
 
 		 587 aa  279  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  32.85 
 
 		 599 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  36.55 
 
 		 587 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  32.48 
 
 		 581 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 556 aa  276  9e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  32.73 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  33.15 
 
 		 556 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  36.34 
 
 		 587 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  36.78 
 
 		 583 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  35.58 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  36.57 
 
 		 583 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  36.08 
 
 		 583 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  37.03 
 
 		 557 aa  270  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  33.01 
 
 		 578 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  34.23 
 
 		 586 aa  269  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  33.46 
 
 		 604 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  32.78 
 
 		 581 aa  266  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  31.41 
 
 		 579 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 		 592 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  35.26 
 
 		 587 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  32.23 
 
 		 578 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  32.12 
 
 		 583 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  34.7 
 
 		 597 aa  263  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  32.85 
 
 		 619 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  35.67 
 
 		 583 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  35.67 
 
 		 583 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  35.67 
 
 		 583 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  32.38 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  33.03 
 
 		 581 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  33.03 
 
 		 580 aa  260  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 576 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  33.03 
 
 		 580 aa  260  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  33.03 
 
 		 577 aa  260  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  35.3 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  32.85 
 
 		 580 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  32.85 
 
 		 580 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  32.85 
 
 		 580 aa  258  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  34.33 
 
 		 587 aa  256  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 		 583 aa  256  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  32.85 
 
 		 581 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  31.31 
 
 		 590 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  33.33 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  32.18 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  32.18 
 
 		 580 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  33.64 
 
 		 589 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  34.23 
 
 		 594 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  34.69 
 
 		 580 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  31.2 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  31.2 
 
 		 555 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 579 aa  250  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  31.41 
 
 		 579 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  31.02 
 
 		 555 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  31.2 
 
 		 555 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  31.74 
 
 		 617 aa  250  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  31.41 
 
 		 579 aa  250  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  31.41 
 
 		 579 aa  250  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  32.18 
 
 		 580 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  32.35 
 
 		 580 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 		 579 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  34.24 
 
 		 576 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  31.72 
 
 		 557 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  32 
 
 		 580 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 		 579 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 		 579 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 		 579 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  33.06 
 
 		 588 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  31.43 
 
 		 645 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 		 577 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  32.61 
 
 		 594 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  34.06 
 
 		 589 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  30.88 
 
 		 645 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08826  gamma-glutamyltranspeptidase  31.48 
 
 		 563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  32.06 
 
 		 593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  33.7 
 
 		 586 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  30.99 
 
 		 557 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  30.99 
 
 		 557 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  32.06 
 
 		 576 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  32.45 
 
 		 575 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  33.76 
 
 		 584 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 		 574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  33.82 
 
 		 586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  31.35 
 
 		 575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 610 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  33.54 
 
 		 577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  31.43 
 
 		 606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  31.85 
 
 		 578 aa  233  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  33.67 
 
 		 583 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  30.98 
 
 		 560 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 		 583 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  31.06 
 
 		 586 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  34.14 
 
 		 590 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>