More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4194 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2313  gamma-glutamyltransferase 1  77.78 
 
 		 546 aa  850    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1640  gamma-glutamyltransferase  95.58 
 
 		 543 aa  1073    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4194  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 543 aa  1123    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2474  gamma-glutamyltransferase  58.91 
 
 		 537 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4692  gamma-glutamyltransferase  45.32 
 
 		 536 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1448  gamma-glutamyltransferase  41.64 
 
 		 564 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.699084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2169  gamma-glutamyltransferase  41.59 
 
 		 558 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  32.84 
 
 		 582 aa  277  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  32.85 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  32.12 
 
 		 581 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  32.77 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  35.95 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  35.52 
 
 		 587 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  33.81 
 
 		 586 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  32 
 
 		 576 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  36.08 
 
 		 587 aa  267  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.08 
 
 		 557 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  35.74 
 
 		 583 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  35.46 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 578 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  32.69 
 
 		 604 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  32.23 
 
 		 578 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  30.69 
 
 		 579 aa  259  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  31.93 
 
 		 583 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  32.05 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  32.49 
 
 		 581 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 583 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 583 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  32.49 
 
 		 580 aa  256  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  32.49 
 
 		 580 aa  256  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  32.49 
 
 		 577 aa  256  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  32.12 
 
 		 579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  34.85 
 
 		 583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  32.3 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  32.3 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  32.3 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  31.94 
 
 		 619 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  33.68 
 
 		 592 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  34.71 
 
 		 587 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  34.23 
 
 		 587 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  34.6 
 
 		 594 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  32.55 
 
 		 583 aa  253  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  34.02 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  33.47 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  32.3 
 
 		 581 aa  252  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  30.94 
 
 		 590 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  32.97 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  32.18 
 
 		 576 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  31.82 
 
 		 580 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 579 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  31.56 
 
 		 617 aa  249  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  33.26 
 
 		 588 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  31.64 
 
 		 580 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 579 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  31.05 
 
 		 579 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  33.88 
 
 		 577 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 579 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 579 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 579 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  31.05 
 
 		 579 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  31.05 
 
 		 579 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  31.82 
 
 		 580 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  33.53 
 
 		 580 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  33.21 
 
 		 589 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  33.22 
 
 		 577 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  33.15 
 
 		 594 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  30.66 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  31.8 
 
 		 580 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  30.47 
 
 		 555 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  32.86 
 
 		 576 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  31.45 
 
 		 580 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  32.23 
 
 		 593 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  30.47 
 
 		 555 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  33.7 
 
 		 589 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  31.07 
 
 		 645 aa  240  5e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08826  gamma-glutamyltranspeptidase  31.31 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  33.87 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  31.46 
 
 		 557 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  33.27 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 645 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  30.25 
 
 		 555 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  32.05 
 
 		 575 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  31.77 
 
 		 560 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  30.63 
 
 		 575 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  33.4 
 
 		 590 aa  233  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  33.13 
 
 		 583 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  30.27 
 
 		 557 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  30.27 
 
 		 557 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  30.88 
 
 		 573 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  30.88 
 
 		 573 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  33.6 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  30.88 
 
 		 573 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  30.88 
 
 		 573 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  31.14 
 
 		 606 aa  231  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  32.97 
 
 		 584 aa  230  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  30.88 
 
 		 573 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  30.88 
 
 		 573 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>