More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2474 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1640  gamma-glutamyltransferase  59.47 
 
 		 543 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2474  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 537 aa  1096    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2313  gamma-glutamyltransferase 1  61.24 
 
 		 546 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4194  gamma-glutamyltransferase  58.91 
 
 		 543 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4692  gamma-glutamyltransferase  52.15 
 
 		 536 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2169  gamma-glutamyltransferase  46.96 
 
 		 558 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1448  gamma-glutamyltransferase  45.07 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.699084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  33.9 
 
 		 556 aa  303  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  33.9 
 
 		 556 aa  302  9e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  37.68 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  36.23 
 
 		 583 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  36.31 
 
 		 580 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  36.08 
 
 		 587 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 555 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 555 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 583 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 555 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  34.37 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  36.02 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  36.02 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  34.55 
 
 		 581 aa  277  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  35.82 
 
 		 583 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  36.02 
 
 		 587 aa  276  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  34.3 
 
 		 579 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  35.2 
 
 		 587 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  35.61 
 
 		 586 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  35.89 
 
 		 592 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  35.27 
 
 		 578 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  32.97 
 
 		 619 aa  272  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  33.45 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  33.45 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  34.65 
 
 		 583 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  33.45 
 
 		 557 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 555 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  31.32 
 
 		 579 aa  270  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  35.48 
 
 		 597 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 		 587 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08826  gamma-glutamyltranspeptidase  32.86 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  32.95 
 
 		 604 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  34.62 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 		 588 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  34.78 
 
 		 587 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  34.62 
 
 		 594 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  31.75 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  31.01 
 
 		 581 aa  264  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  32.19 
 
 		 576 aa  263  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  32.48 
 
 		 645 aa  263  8.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  33.7 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  33.58 
 
 		 589 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  32.75 
 
 		 617 aa  260  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  34.04 
 
 		 590 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  31.56 
 
 		 582 aa  260  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  32.29 
 
 		 645 aa  259  7e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  31.87 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  31.87 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  33.85 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  31.68 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  33.71 
 
 		 576 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  32.86 
 
 		 560 aa  256  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  34.44 
 
 		 594 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  32.54 
 
 		 583 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  32.37 
 
 		 606 aa  256  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  34.9 
 
 		 587 aa  256  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  31.01 
 
 		 579 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  35.07 
 
 		 586 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  34.27 
 
 		 583 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  33.95 
 
 		 580 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  31.14 
 
 		 579 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  31.14 
 
 		 579 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  33.95 
 
 		 580 aa  253  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  35.03 
 
 		 576 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  35.03 
 
 		 576 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  31.01 
 
 		 579 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  34.16 
 
 		 580 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 		 573 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 		 573 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 		 573 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  33.95 
 
 		 580 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 		 588 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  33.54 
 
 		 580 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  33.54 
 
 		 580 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  33.15 
 
 		 573 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  32.85 
 
 		 573 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  33.75 
 
 		 581 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  32.87 
 
 		 576 aa  250  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  34.87 
 
 		 583 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  30.83 
 
 		 579 aa  250  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  33.75 
 
 		 577 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  33.54 
 
 		 581 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  34.61 
 
 		 578 aa  249  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  33.54 
 
 		 580 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 580 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  33.54 
 
 		 580 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  34.22 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  30.69 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  33.75 
 
 		 580 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  36.32 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  34.06 
 
 		 593 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  33.1 
 
 		 589 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>