More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4692 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4692  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
536 aa  1105    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2474  gamma-glutamyltransferase  52.15 
 
 
537 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1640  gamma-glutamyltransferase  45.69 
 
 
543 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4194  gamma-glutamyltransferase  45.32 
 
 
543 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2313  gamma-glutamyltransferase 1  46.1 
 
 
546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1448  gamma-glutamyltransferase  43.47 
 
 
564 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.699084  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2169  gamma-glutamyltransferase  43.93 
 
 
558 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445992  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  37.86 
 
 
578 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  34.85 
 
 
556 aa  290  4e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  34.85 
 
 
556 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  37.76 
 
 
586 aa  286  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  35.89 
 
 
580 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  36.45 
 
 
557 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  37.07 
 
 
583 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  36.51 
 
 
580 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  34.06 
 
 
619 aa  279  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.89 
 
 
580 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.68 
 
 
580 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  35.89 
 
 
581 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.68 
 
 
580 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  35.89 
 
 
580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  35.8 
 
 
578 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  35.89 
 
 
580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  35.89 
 
 
580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  35.89 
 
 
580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  36.06 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  35.68 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  35.68 
 
 
580 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.89 
 
 
577 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  35.9 
 
 
583 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  35.64 
 
 
590 aa  273  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  33.64 
 
 
581 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  35.9 
 
 
583 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  34.94 
 
 
580 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  34.5 
 
 
587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  35.66 
 
 
579 aa  270  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  35.66 
 
 
594 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  36.05 
 
 
583 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  32.85 
 
 
604 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  34.29 
 
 
587 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  34.29 
 
 
587 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  35.93 
 
 
583 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  35.93 
 
 
583 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  33.64 
 
 
589 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  36.48 
 
 
574 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  32.85 
 
 
645 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 
581 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 
576 aa  267  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  33.39 
 
 
645 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  34.25 
 
 
576 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  32.9 
 
 
599 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  35.74 
 
 
587 aa  264  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  32.43 
 
 
583 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  33.88 
 
 
587 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  32.58 
 
 
593 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  34.72 
 
 
594 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  37.09 
 
 
578 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  37.76 
 
 
576 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  34.63 
 
 
592 aa  261  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  37.76 
 
 
576 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  34.3 
 
 
577 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  33.58 
 
 
583 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  35.63 
 
 
588 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1885  gamma-glutamyltransferase  34.64 
 
 
567 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  36.63 
 
 
579 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  32.65 
 
 
587 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  31.78 
 
 
617 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  34.08 
 
 
599 aa  258  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  33.81 
 
 
597 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  32.32 
 
 
555 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  32.32 
 
 
555 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  32.49 
 
 
606 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  32.32 
 
 
555 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  36.73 
 
 
578 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  33.94 
 
 
581 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  33.33 
 
 
557 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  31.96 
 
 
555 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  31.54 
 
 
582 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 
586 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  34.27 
 
 
576 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  35.79 
 
 
575 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  32.87 
 
 
571 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  33.87 
 
 
586 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  33.15 
 
 
557 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  33.6 
 
 
583 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  31.74 
 
 
588 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  32.43 
 
 
557 aa  246  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  34.76 
 
 
575 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  32.66 
 
 
586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  34.76 
 
 
575 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  32.02 
 
 
579 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  32.56 
 
 
589 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  33.09 
 
 
584 aa  243  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  32.48 
 
 
583 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  32.78 
 
 
577 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  31.49 
 
 
588 aa  242  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  31.61 
 
 
586 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  32.9 
 
 
576 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 
617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  32.97 
 
 
573 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>