More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6704 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 
557 aa  1110    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  41.18 
 
 
556 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  39.41 
 
 
577 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  40.07 
 
 
581 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  43.92 
 
 
586 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  38.7 
 
 
581 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  39.03 
 
 
580 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  39.22 
 
 
580 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  39.03 
 
 
580 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  39.22 
 
 
580 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  39.03 
 
 
580 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  39.41 
 
 
580 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  39.03 
 
 
580 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  40.99 
 
 
556 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  38.52 
 
 
581 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  39.03 
 
 
580 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  38.85 
 
 
580 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  38.85 
 
 
580 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  42.44 
 
 
587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  41.75 
 
 
579 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  42.23 
 
 
587 aa  356  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  41.6 
 
 
581 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  41.6 
 
 
592 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  41.18 
 
 
587 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  41.62 
 
 
576 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  41.62 
 
 
576 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  41.18 
 
 
597 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  41.13 
 
 
578 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  41.18 
 
 
580 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  40.34 
 
 
587 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  43 
 
 
574 aa  346  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  41.61 
 
 
579 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  41.14 
 
 
587 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  41.21 
 
 
610 aa  343  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  40.39 
 
 
606 aa  342  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  41.17 
 
 
589 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  41.31 
 
 
575 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  40.9 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  39.93 
 
 
578 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  41.54 
 
 
578 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  40.78 
 
 
578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  40.9 
 
 
575 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  40.16 
 
 
575 aa  336  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  39.92 
 
 
576 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  39.33 
 
 
593 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  40.46 
 
 
583 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  42.25 
 
 
583 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  40.12 
 
 
576 aa  333  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  41.11 
 
 
594 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 
604 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  41.79 
 
 
594 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  39.47 
 
 
583 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  37.92 
 
 
590 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  39.67 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  40.04 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  39.47 
 
 
583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  39.47 
 
 
583 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 
617 aa  325  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  35.82 
 
 
579 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  39.07 
 
 
586 aa  325  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 
577 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  40.36 
 
 
606 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  42.35 
 
 
586 aa  323  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  40.36 
 
 
633 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  39.25 
 
 
581 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.53 
 
 
576 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  40.11 
 
 
584 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  37.75 
 
 
583 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  38.83 
 
 
590 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  37.02 
 
 
599 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  37.81 
 
 
645 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  39.41 
 
 
586 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  37.24 
 
 
645 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  38.69 
 
 
570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  35.71 
 
 
582 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  37.64 
 
 
583 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  38.64 
 
 
589 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  37.02 
 
 
579 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  36.94 
 
 
581 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  40.08 
 
 
588 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  38.25 
 
 
599 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  37.08 
 
 
579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  37.08 
 
 
579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  36.72 
 
 
579 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  36.72 
 
 
579 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  35.6 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  35.6 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  35.6 
 
 
579 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  38.52 
 
 
583 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  38.83 
 
 
619 aa  303  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  33.87 
 
 
588 aa  297  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1522  gamma-glutamyltransferase  41.22 
 
 
589 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  37.15 
 
 
617 aa  293  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3633  gamma-glutamyltransferase  38.76 
 
 
589 aa  292  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  36.07 
 
 
577 aa  290  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  37.8 
 
 
587 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 
602 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2169  gamma-glutamyltransferase  37.28 
 
 
558 aa  286  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445992  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  39.42 
 
 
579 aa  283  7.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2474  gamma-glutamyltransferase  37.68 
 
 
537 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.255323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>