More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2313 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2313  gamma-glutamyltransferase 1  100 
 
 
546 aa  1116    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1640  gamma-glutamyltransferase  77.76 
 
 
543 aa  874    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4194  gamma-glutamyltransferase  77.78 
 
 
543 aa  867    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2474  gamma-glutamyltransferase  61.46 
 
 
537 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4692  gamma-glutamyltransferase  46.1 
 
 
536 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2169  gamma-glutamyltransferase  42.96 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445992  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1448  gamma-glutamyltransferase  42.64 
 
 
564 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.699084  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.48 
 
 
586 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 
599 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  32.55 
 
 
581 aa  276  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  32.61 
 
 
582 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  33.01 
 
 
579 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  32.86 
 
 
590 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  32.91 
 
 
576 aa  266  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  32.85 
 
 
583 aa  266  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  34.97 
 
 
589 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  32.18 
 
 
581 aa  264  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  35.02 
 
 
592 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  34.43 
 
 
583 aa  263  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  32.65 
 
 
586 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  34.69 
 
 
587 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  34.62 
 
 
597 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  32.17 
 
 
578 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  33.68 
 
 
588 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  31.95 
 
 
580 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  31.95 
 
 
577 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  31.95 
 
 
581 aa  259  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  31.95 
 
 
580 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 
587 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
587 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  31.77 
 
 
580 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  35.7 
 
 
589 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  31.77 
 
 
580 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  31.77 
 
 
580 aa  257  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  31.39 
 
 
617 aa  256  8e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  34.22 
 
 
583 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  34.22 
 
 
583 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 
577 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  34.5 
 
 
583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  34.22 
 
 
583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  31.65 
 
 
579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 
556 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 
556 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  31.77 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  31.88 
 
 
579 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  34.29 
 
 
583 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  32.19 
 
 
580 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  33.68 
 
 
555 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  31.21 
 
 
578 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  31.84 
 
 
579 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  31.7 
 
 
579 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  31.7 
 
 
579 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
583 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  31.06 
 
 
619 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  33.47 
 
 
555 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  35.13 
 
 
557 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  33.47 
 
 
555 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  31.79 
 
 
579 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  34.22 
 
 
587 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  34.3 
 
 
594 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  31.79 
 
 
579 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  33.68 
 
 
555 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  32.82 
 
 
604 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  31.57 
 
 
579 aa  250  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  31.93 
 
 
581 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  31.61 
 
 
579 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  35.45 
 
 
574 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  31.65 
 
 
580 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  33.47 
 
 
587 aa  247  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  32.97 
 
 
606 aa  247  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  33.39 
 
 
576 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  30.84 
 
 
645 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  30.84 
 
 
645 aa  246  8e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  32 
 
 
576 aa  246  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  33.13 
 
 
599 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  34.51 
 
 
587 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  31.91 
 
 
575 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
594 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  31.65 
 
 
580 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 
580 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  31.73 
 
 
575 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  31.65 
 
 
580 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  33.04 
 
 
593 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  31.26 
 
 
580 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  32.79 
 
 
575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  31.65 
 
 
576 aa  241  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  32.44 
 
 
586 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  35.31 
 
 
581 aa  238  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  34.27 
 
 
590 aa  237  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  33.4 
 
 
578 aa  237  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 
557 aa  237  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
577 aa  234  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  32.07 
 
 
577 aa  233  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  32.79 
 
 
576 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  32.79 
 
 
576 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 
586 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  33.46 
 
 
584 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  32.53 
 
 
576 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  32.26 
 
 
570 aa  231  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  32.93 
 
 
596 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>