More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3663 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
393 aa  750    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  89.61 
 
 
396 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  69.97 
 
 
393 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  61.1 
 
 
409 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  62.69 
 
 
404 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  57.91 
 
 
436 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  62.24 
 
 
395 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  63.06 
 
 
386 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  61.68 
 
 
394 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  62.13 
 
 
415 aa  348  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  59.95 
 
 
401 aa  343  4e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  61.13 
 
 
436 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  60.71 
 
 
401 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  58.02 
 
 
399 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  50.52 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  49.61 
 
 
384 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  49.35 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  49.35 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  49.18 
 
 
385 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  53.74 
 
 
387 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  48.91 
 
 
388 aa  259  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  46.74 
 
 
373 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 
403 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  37.63 
 
 
403 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  36.75 
 
 
400 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.94 
 
 
407 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 
407 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  35.46 
 
 
427 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  30.94 
 
 
407 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  30.69 
 
 
407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.69 
 
 
407 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.69 
 
 
407 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.69 
 
 
407 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.69 
 
 
407 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.51 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.51 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.29 
 
 
399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.29 
 
 
399 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.03 
 
 
399 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 
399 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.03 
 
 
399 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.03 
 
 
399 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 
399 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 
399 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.03 
 
 
399 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.39 
 
 
399 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 
400 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
412 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 
414 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 
408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 
391 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
405 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  34.03 
 
 
395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  32.65 
 
 
399 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 
381 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
441 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 
586 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.4 
 
 
587 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 
586 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.48 
 
 
586 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.39 
 
 
587 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 
656 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 
782 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 
586 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.57 
 
 
587 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 
585 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.96 
 
 
585 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.74 
 
 
585 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
657 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
747 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 
586 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 
671 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 
585 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.45 
 
 
585 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.05 
 
 
720 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.03 
 
 
671 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 
673 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 
664 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 
666 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  28.38 
 
 
652 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 
567 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 
777 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  26.02 
 
 
649 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 
757 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  26.02 
 
 
648 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 
567 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 
658 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.23 
 
 
648 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 
741 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0387  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 
565 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.23 
 
 
648 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  27.59 
 
 
385 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  27.47 
 
 
682 aa  90.1  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.23 
 
 
648 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 
598 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  27.88 
 
 
562 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
674 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  28.13 
 
 
563 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>