50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1510 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1510  ribosomal protein L24  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.23231e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1767  ribosomal protein L24  53.45 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0099  50S ribosomal protein L24P  52.59 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0397567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0721  50S ribosomal protein L24P  55.24 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00357175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0655  50S ribosomal protein L24P  55.24 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000112654  decreased coverage  0.0000623548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0168  50S ribosomal protein L24P  55.24 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000717703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1395  50S ribosomal protein L24P  52.38 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1748  50S ribosomal protein L24P  51.38 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0064747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1263  50S ribosomal protein L24P  54.29 
 
 		 119 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000423143  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0244  50S ribosomal protein L24P  51.35 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1717  50S ribosomal protein L24P  52.17 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1729  50S ribosomal protein L24P  48.21 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358775  hitchhiker  0.000743804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1549  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00542719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0575  50S ribosomal protein L24P  48.25 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2242  50S ribosomal protein L24P  46.49 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000394393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0012  50S ribosomal protein L24P  50.91 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000112293  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0453  50S ribosomal protein L24P  43.7 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0106064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1833  ribosomal protein L24  41.8 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0092  50S ribosomal protein L24P  46.43 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.477291 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2438  50S ribosomal protein L24P  43.12 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.794069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0221  ribosomal protein L24  40.32 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2303  50S ribosomal protein L24P  38.94 
 
 		 119 aa  91.3  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1839  ribosomal protein L24  40.37 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0559  50S ribosomal protein L24P  48.67 
 
 		 123 aa  90.5  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00168137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2229  ribosomal protein L24  40.71 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0799  KOW domain-containing protein  39.04 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.204227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0543  50S ribosomal protein L24P  41.96 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0102  KOW domain-containing protein  41.67 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000512448  unclonable  0.000000470993 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05030  structural constituent of ribosome, putative  39.42 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.856107  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00570  ribosomal protein L26 (AFU_orthologue; AFUA_6G11260)  40.38 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.604123  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8655  Ribosomal protein L26, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.36 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777718  normal  0.0305083 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11032  predicted protein  40 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.070507  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65387  ribosomal protein L26A (L33A) (YL33)  36.28 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  36.96 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  40.48 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  37.5 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  36.96 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  39.74 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  41.03 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  43.42 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  38.96 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  38.1 
 
 		 109 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0685  50S ribosomal protein L24  32.93 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  43.48 
 
 		 106 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  33.73 
 
 		 106 aa  41.6  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  33.98 
 
 		 118 aa  41.6  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  48.78 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  33.98 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  35.48 
 
 		 104 aa  40.4  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>