More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0685 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0685  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
108 aa  209  9e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl134  50S ribosomal protein L24  70.09 
 
 
109 aa  154  3e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  50.54 
 
 
102 aa  84  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  46.24 
 
 
102 aa  77  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  48.57 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  44.66 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  43.4 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  46.88 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  45.74 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  40.38 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  41.9 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  41.41 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  44.68 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  46.81 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  37.62 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  40.19 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  39 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  38.61 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  40.78 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  39.58 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  38 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  40.57 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  42.42 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  38.54 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  37 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  38.54 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  40.82 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  38.24 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  37.04 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  36.27 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  38.78 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  35.35 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  41.49 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  40.59 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  42.11 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  36 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  37.5 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0260  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0016412  hitchhiker  0.00832042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  39.22 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  41.07 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  38.61 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  38.61 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  39.81 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1935  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000142192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2621  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3765  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000275135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3057  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3793  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3489  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00124411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  41.84 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3158  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000569435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  35.71 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3735  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000153975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  38.24 
 
 
104 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3168  50S ribosomal protein L24  40.4 
 
 
102 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000400105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  38.78 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  41.75 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  38.78 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  40.37 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3938  50S ribosomal protein L24  40.57 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  37.86 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  39.81 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  37.86 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  37.86 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  39.62 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  42.45 
 
 
112 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  39.81 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  37.37 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  41.05 
 
 
101 aa  57  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0287  50S ribosomal protein L24  40.4 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000208318  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0500  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000146538  decreased coverage  0.00101346 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  39.81 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>