4293 genes were found for organism Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
YpsIP31758_0001  CDS  NC_009708  21  461  -  441  flavodoxin  YP_001399005  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0002  CDS  NC_009708  554  1015  -  462  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  YP_001399006  hitchhiker  0.000000000470477  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0003  CDS  NC_009708  1185  2177  +  993  asparagine synthetase AsnA  YP_001399007  hitchhiker  0.00000347674  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0004  CDS  NC_009708  2276  3742  -  1467  hypothetical protein  YP_001399008  hitchhiker  0.000586719  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0005  CDS  NC_009708  3746  5284  -  1539  regulatory ATPase RavA  YP_001399009  normal  0.016355  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0006  CDS  NC_009708  5558  7426  +  1869  potassium transport protein Kup  YP_001399010  normal  0.0279816  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0007  CDS  NC_009708  7631  8050  +  420  D-ribose pyranase  YP_001399011  normal  0.0142466  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0008  CDS  NC_009708  8101  9027  +  927  ribokinase  YP_001399012  normal  0.0252287  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0009  CDS  NC_009708  9247  10671  -  1425  major facilitator transporter  YP_001399014  hitchhiker  0.000535821  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0010  CDS  NC_009708  9047  9250  +  204  hypothetical protein  YP_001399013  normal  0.0502458  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0011  CDS  NC_009708  10751  11440  -  690  GntR family transcriptional regulator  YP_001399015  hitchhiker  0.00000398907  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0015  CDS  NC_009708  17641  18849  +  1209  IS285, transposase  YP_001399016  hitchhiker  0.0000501092  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0016  CDS  NC_009708  18907  19440  -  534  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  YP_001399017  hitchhiker  0.0000527926  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0017  CDS  NC_009708  19437  20024  -  588  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  YP_001399018  hitchhiker  0.00016847  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0018  CDS  NC_009708  20178  20447  +  270  hypothetical protein  YP_001399019  hitchhiker  0.0000602273  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0019  CDS  NC_009708  20538  21524  +  987  serine/threonine protein kinase  YP_001399020  hitchhiker  0.0000857443  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0020  CDS  NC_009708  21552  22175  +  624  periplasmic protein disulfide isomerase I  YP_001399021  hitchhiker  0.000268168  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0021  CDS  NC_009708  22666  25464  +  2799  DNA polymerase I  YP_001399022  decreased coverage  0.00121039  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0022  CDS  NC_009708  25872  26522  -  651  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  YP_001399023  hitchhiker  0.00273485  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0023  CDS  NC_009708  27266  27832  +  567  hypothetical protein  YP_001399024  hitchhiker  0.00725137  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0024  CDS  NC_009708  28015  29388  +  1374  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001399025  normal  0.0201476  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0025  CDS  NC_009708  29442  30854  -  1413  nitrogen regulation protein NR(I)  YP_001399026  normal  0.151443  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0026  CDS  NC_009708  30862  31911  -  1050  nitrogen regulation protein NR(II)  YP_001399027  normal  0.968773  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0027  CDS  NC_009708  32164  33573  -  1410  glutamine synthetase  YP_001399028  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0028  CDS  NC_009708  34135  35958  +  1824  GTP-binding protein TypA/BipA  YP_001399029  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0029  CDS  NC_009708  36281  36871  +  591  phosphatase  YP_001399030  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0030  CDS  NC_009708  36968  37852  +  885  ribonuclease BN  YP_001399031  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0031  CDS  NC_009708  37859  38296  +  438  D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase  YP_001399032  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0032  CDS  NC_009708  38482  39405  +  924  acetyltransferase domain-containing protein  YP_001399033  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0033  CDS  NC_009708  39540  41249  -  1710  asmA family protein  YP_001399034  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0034  CDS  NC_009708  41396  42781  -  1386  xanthine permease  YP_001399035  normal  0.830973  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0035  CDS  NC_009708  42780  42899  +  120  hypothetical protein  YP_001399036  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0036  CDS  NC_009708  43019  44233  +  1215  sodium/glutamate symporter  YP_001399037  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0037  CDS  NC_009708  44599  46680  -  2082  ATP-dependent DNA helicase RecG  YP_001399038  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0038  CDS  NC_009708  46681  47373  -  693  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  YP_001399039  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0039  CDS  NC_009708  47379  49487  -  2109  bifunctional (p)ppGpp synthetase II/ guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  YP_001399040  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0040  CDS  NC_009708  49507  49782  -  276  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  YP_001399041  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0041  CDS  NC_009708  49837  50460  -  624  guanylate kinase  YP_001399042  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0042  CDS  NC_009708  50861  52564  +  1704  NAD-dependent DNA ligase LigB  YP_001399043  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0043  CDS  NC_009708  52584  53201  -  618  hypothetical protein  YP_001399044  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0044  CDS  NC_009708  53942  54313  +  372  hypothetical protein  YP_001399045  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0045  CDS  NC_009708  54330  54542  -  213  hypothetical protein  YP_001399046  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0046  CDS  NC_009708  54572  55174  -  603  putative phage terminase, small subunit  YP_001399047  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0047  CDS  NC_009708  55921  56997  -  1077  hypothetical protein  YP_001399048  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0048  CDS  NC_009708  57544  57666  -  123  hypothetical protein  YP_001399049  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0049  CDS  NC_009708  57623  58774  -  1152  hypothetical protein  YP_001399050  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0050  CDS  NC_009708  58771  59781  -  1011  hypothetical protein  YP_001399051  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0051  CDS  NC_009708  59796  60215  -  420  hypothetical protein  YP_001399052  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0052  CDS  NC_009708  60215  60433  -  219  AlpA family protein  YP_001399053  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0053  CDS  NC_009708  60547  61440  -  894  hypothetical protein  YP_001399054  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0054  CDS  NC_009708  61537  62805  -  1269  phage integrase family site specific recombinase  YP_001399055  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0055  CDS  NC_009708  62995  63858  -  864  hypothetical protein  YP_001399056  normal  0.926553  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0056  CDS  NC_009708  63985  64701  +  717  ribonuclease PH  YP_001399057  normal  0.187742  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0057  CDS  NC_009708  64868  65515  +  648  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001399058  normal  0.0177997  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0058  CDS  NC_009708  65650  66246  -  597  nucleoid occlusion protein  YP_001399059  hitchhiker  0.00579463  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0059  CDS  NC_009708  66368  66823  -  456  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  YP_001399060  hitchhiker  0.000312037  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0060  CDS  NC_009708  66804  68018  -  1215  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  YP_001399061  hitchhiker  0.00000696235  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0061  CDS  NC_009708  68215  68883  +  669  DNA repair protein RadC  YP_001399062  decreased coverage  0.0000000803057  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0062  CDS  NC_009708  69146  69382  +  237  50S ribosomal protein L28  YP_001399063  hitchhiker  0.0000000140905  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0063  CDS  NC_009708  69394  69561  +  168  50S ribosomal protein L33  YP_001399064  hitchhiker  0.0000004658  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0064  CDS  NC_009708  69644  70453  +  810  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_001399065  hitchhiker  0.00000168259  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0065  CDS  NC_009708  70459  70938  -  480  phosphopantetheine adenylyltransferase  YP_001399066  hitchhiker  0.00000149443  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0066  CDS  NC_009708  70935  71717  -  783  glycosyl transferase, group 2 family protein  YP_001399067  hitchhiker  0.0000310001  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0067  CDS  NC_009708  71718  72995  -  1278  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase  YP_001399068  hitchhiker  0.00847091  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0068  CDS  NC_009708  73415  74380  -  966  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  YP_001399069  normal  0.0575052  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0069  CDS  NC_009708  74380  75444  -  1065  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  YP_001399070  normal  0.270694  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0070  CDS  NC_009708  75475  76407  -  933  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  YP_001399071  normal  0.495588  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0071  CDS  NC_009708  76653  77864  +  1212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  YP_001399072  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0072  CDS  NC_009708  77874  78899  +  1026  L-threonine 3-dehydrogenase  YP_001399073  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0073  CDS  NC_009708  79037  80047  -  1011  divergent polysaccharide deacetylase  YP_001399074  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0074  CDS  NC_009708  80071  81441  -  1371  hypothetical protein  YP_001399075  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0075  CDS  NC_009708  81451  82998  -  1548  phosphoglyceromutase  YP_001399076  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0076  CDS  NC_009708  83395  83829  +  435  rhodanese domain-containing protein  YP_001399077  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0077  CDS  NC_009708  83948  84196  +  249  glutaredoxin 3  YP_001399078  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0078  CDS  NC_009708  84284  84760  +  477  preprotein translocase subunit SecB  YP_001399079  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0079  CDS  NC_009708  84760  85779  +  1020  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_001399080  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0080  CDS  NC_009708  86045  86866  +  822  serine acetyltransferase  YP_001399081  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0081  CDS  NC_009708  86989  87477  -  489  RNA methyltransferase  YP_001399082  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0082  CDS  NC_009708  87666  88730  +  1065  ada regulatory protein  YP_001399083  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0083  CDS  NC_009708  88798  90174  -  1377  two-component sensor protein  YP_001399084  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0084  CDS  NC_009708  90171  90869  -  699  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  YP_001399085  normal  0.601085  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0085  CDS  NC_009708  91043  91531  +  489  periplasmic stress adaptor protein CpxP  YP_001399086  normal  0.359879  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0086  CDS  NC_009708  92209  93168  +  960  putative transposase  YP_001399087  normal  0.864811  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0087    NC_009708  93236  93608  -  373      normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0088  CDS  NC_009708  93730  94632  +  903  ferrous iron efflux protein F  YP_001399088  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0089  CDS  NC_009708  94850  95833  +  984  6-phosphofructokinase  YP_001399089  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0090  CDS  NC_009708  96054  97043  +  990  sulfate transporter subunit  YP_001399090  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0091  CDS  NC_009708  97293  98069  -  777  hypothetical protein  YP_001399091  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0092  CDS  NC_009708  98187  99614  -  1428  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  YP_001399092  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0093  CDS  NC_009708  99680  100393  -  714  hypothetical protein  YP_001399093  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0094  CDS  NC_009708  100390  101127  -  738  GlcNAc-PI de-N-acetylase family  YP_001399094  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0095  CDS  NC_009708  101264  102499  +  1236  LysR family substrate binding transcriptional regulator  YP_001399095  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0096  CDS  NC_009708  102729  103496  -  768  triosephosphate isomerase  YP_001399096  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0097  CDS  NC_009708  103625  104239  -  615  hypothetical protein  YP_001399097  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0098  CDS  NC_009708  104381  104842  +  462  hypothetical protein  YP_001399098  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0099  CDS  NC_009708  105238  105984  -  747  ferredoxin-NADP reductase  YP_001399099  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0100  CDS  NC_009708  106139  107149  -  1011  fructose 1,6-bisphosphatase II  YP_001399100  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0101  CDS  NC_009708  107418  108941  -  1524  glycerol kinase  YP_001399101  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0102  CDS  NC_009708  109118  109966  -  849  glycerol uptake facilitator protein  YP_001399102  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
YpsIP31758_0103  CDS  NC_009708  110674  110913  +  240  hypothetical protein  YP_001399103  normal  1  n/a    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>