56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0003 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_4214  asparagine synthetase AsnA  100 
 
 		 330 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0003  asparagine synthetase AsnA  100 
 
 		 330 aa  670    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.52429  normal  0.646496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0003  asparagine synthetase AsnA  100 
 
 		 330 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000347674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4245  asparagine synthetase AsnA  80 
 
 		 330 aa  557  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4535  asparagine synthetase AsnA  80.3 
 
 		 330 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4905  asparagine synthetase AsnA  83.02 
 
 		 330 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000321879  hitchhiker  0.000612587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4120  asparagine synthetase AsnA  79.39 
 
 		 330 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0853611  normal  0.0158301 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4223  aspartate/ammonia ligase  78.48 
 
 		 330 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03572  hypothetical protein  78.18 
 
 		 330 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5180  asparagine synthetase AsnA  78.18 
 
 		 330 aa  541  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0230028  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4112  asparagine synthetase AsnA  77.58 
 
 		 330 aa  541  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0106172  normal  0.169697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4250  asparagine synthetase AsnA  78.48 
 
 		 330 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0372107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3960  asparagine synthetase AsnA  78.48 
 
 		 330 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.138328  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03628  asparagine synthetase AsnA  78.18 
 
 		 330 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.312076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4177  asparagine synthetase AsnA  78.18 
 
 		 330 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.13025  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4260  asparagine synthetase AsnA  77.88 
 
 		 330 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.148939  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4160  asparagine synthetase AsnA  76.67 
 
 		 330 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.340951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4210  asparagine synthetase AsnA  76.97 
 
 		 330 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4089  asparagine synthetase AsnA  76.97 
 
 		 330 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4104  asparagine synthetase AsnA  76.67 
 
 		 330 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000041544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4269  asparagine synthetase AsnA  76.97 
 
 		 330 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.179504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1440  asparagine synthetase AsnA  65.15 
 
 		 333 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.797246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0450  asparagine synthetase AsnA  64.85 
 
 		 330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000314133  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0424  asparagine synthetase AsnA  61.21 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.543605  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1945  asparagine synthetase AsnA  47.9 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2233  asparagine synthetase AsnA  50.65 
 
 		 336 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0946  aspartate/ammonia ligase  47.55 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0069  asparagine synthetase AsnA  49.84 
 
 		 340 aa  305  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000244111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1703  asparagine synthetase AsnA  45.68 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1786  asparagine synthetase AsnA  48.28 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000156633  hitchhiker  2.77928e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3449  asparagine synthetase AsnA  47.65 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44902  predicted protein  44.76 
 
 		 382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1885  asparagine synthetase AsnA  45.82 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000727816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2575  asparagine synthetase AsnA  45.83 
 
 		 336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00216913  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1444  asparagine synthetase AsnA  45.54 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1672  asparagine synthetase AsnA  45.45 
 
 		 327 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.408642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1427  asparagine synthetase AsnA  44.83 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1588  aspartate/ammonia ligase  44.16 
 
 		 336 aa  276  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1819  asparagine synthetase AsnA  44.51 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.631183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1928  asparagine synthetase AsnA  44.51 
 
 		 327 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3523  asparagine synthetase AsnA  45.37 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1655  asparagine synthetase AsnA  44.51 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1673  asparagine synthetase AsnA  44.51 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1808  asparagine synthetase AsnA  44.51 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1620  asparagine synthetase AsnA  44.51 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1880  asparagine synthetase AsnA  44.51 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.701905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1853  asparagine synthetase AsnA  44.2 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.04315e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24030  asparagine synthetase AsnA  43.77 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.528692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0084  asparagine synthetase AsnA  43.89 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0576  asparagine synthetase AsnA  41.92 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0372  asparagine synthetase AsnA  40.67 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0817  asparagine synthetase AsnA  40.43 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.321948  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18911  aspartate--ammonia ligase  36.66 
 
 		 387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 		 511 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 562 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 514 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>