23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0097 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0096  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  410  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4117  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  410  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0097  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4804  hypothetical protein  64.39 
 
 
201 aa  252  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000594134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4051  hypothetical protein  58.03 
 
 
198 aa  220  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4481  hypothetical protein  57.22 
 
 
198 aa  217  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489944  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4328  hypothetical protein  57.22 
 
 
198 aa  217  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4298  hypothetical protein  57.22 
 
 
198 aa  217  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4413  hypothetical protein  57.22 
 
 
198 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0799519  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4411  hypothetical protein  57.22 
 
 
198 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03805  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5375  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4400  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03754  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4454  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4098  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  210  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4151  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  210  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4065  protein of unknown function DUF1454  55.9 
 
 
199 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4360  hypothetical protein  55.9 
 
 
199 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.58734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0155  hypothetical protein  61.2 
 
 
199 aa  208  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3807  protein of unknown function DUF1454  58.24 
 
 
197 aa  208  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0170  protein of unknown function DUF1454  61.2 
 
 
199 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0104  protein of unknown function DUF1454  59.04 
 
 
208 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>