32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0752 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  100 
 
 		 143 aa  304  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  64.03 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  63.7 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  59.44 
 
 		 152 aa  184  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  62.5 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  61.76 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  62.5 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  57.04 
 
 		 152 aa  179  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  61.76 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  58.21 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  61.76 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  60.28 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  61.03 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  59.7 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  61.76 
 
 		 161 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  61.76 
 
 		 161 aa  176  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  61.03 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  39.86 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  35.42 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  32.59 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  36.43 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  34.85 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  35.42 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  37.4 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  34.56 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  37.68 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  32.58 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  31.34 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  31.85 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  29.1 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  29.85 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  29.1 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>