32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3208 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  100 
 
 		 159 aa  338  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  99.37 
 
 		 159 aa  336  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  98.74 
 
 		 159 aa  333  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  98.11 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  91.82 
 
 		 159 aa  310  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  90.32 
 
 		 160 aa  298  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  86.96 
 
 		 161 aa  294  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  91.82 
 
 		 157 aa  284  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  90.68 
 
 		 161 aa  284  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  87.58 
 
 		 161 aa  277  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  87.58 
 
 		 161 aa  276  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  67.97 
 
 		 152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  68.97 
 
 		 152 aa  215  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  71.53 
 
 		 156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  69.01 
 
 		 152 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  60.78 
 
 		 152 aa  185  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  62.5 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  39.44 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  39.01 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  35.04 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  34.56 
 
 		 134 aa  84.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  37.04 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  39.01 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  34.07 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  35.77 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  30 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  35.61 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  29.71 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  28.99 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  27.54 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  26.81 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  27.54 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>