32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3358 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  100 
 
 
152 aa  322  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  76.32 
 
 
152 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  74.34 
 
 
152 aa  249  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  70.13 
 
 
159 aa  227  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  64.6 
 
 
161 aa  224  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  72.59 
 
 
156 aa  221  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  65.79 
 
 
160 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  69.66 
 
 
161 aa  207  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  63.35 
 
 
161 aa  206  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  66.24 
 
 
157 aa  206  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  66.01 
 
 
161 aa  204  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  68.28 
 
 
159 aa  202  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  68.75 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  67.36 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  68.75 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  59.44 
 
 
143 aa  184  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  61.19 
 
 
152 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  38.69 
 
 
143 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  40.74 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  38.62 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  36.57 
 
 
134 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  39.46 
 
 
142 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  35.46 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  36.84 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  34.07 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  34.07 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  37.04 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  30.15 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  30.88 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  28.68 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  28.68 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  30.16 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>