24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0005 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  100 
 
 
141 aa  297  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  97.87 
 
 
141 aa  291  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  96.45 
 
 
141 aa  286  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  92.2 
 
 
141 aa  275  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  92.2 
 
 
141 aa  274  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  40.15 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  33.09 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  32.86 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  35.29 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  40.91 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  34.51 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  33.57 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  32.12 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  29.29 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  39.29 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  32.35 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  29.85 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  30.83 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  30.16 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  28.87 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  31.34 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  32.41 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  27.66 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  26.9 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>