32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3349 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  100 
 
 
160 aa  340  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  95.65 
 
 
161 aa  321  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  93.79 
 
 
161 aa  303  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  93.79 
 
 
161 aa  298  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  91.61 
 
 
159 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  92.55 
 
 
161 aa  297  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  88.39 
 
 
159 aa  277  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  87.74 
 
 
159 aa  275  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  87.1 
 
 
159 aa  272  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  86.45 
 
 
159 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  84.47 
 
 
157 aa  269  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  68.42 
 
 
152 aa  221  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  65.79 
 
 
152 aa  216  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  71.74 
 
 
156 aa  214  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  65.13 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  63.7 
 
 
143 aa  186  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  59.87 
 
 
152 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  39.86 
 
 
143 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  38.36 
 
 
142 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  35.25 
 
 
137 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  39.26 
 
 
140 aa  85.1  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  34.07 
 
 
134 aa  84  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  39.04 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  33.57 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  36.03 
 
 
140 aa  77  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  33.09 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  35.82 
 
 
140 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  29.79 
 
 
141 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  29.08 
 
 
141 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  27.66 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  27.01 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  27.66 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>