32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5243 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  54.68 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  56.12 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  50.77 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  42.11 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  41.01 
 
 		 142 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  39.68 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  38.89 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  36.11 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  37.12 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  41.35 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  36.43 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  32.33 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  34.07 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  33.33 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  34.31 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  30.34 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  33.1 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  34.31 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  33.1 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  33.09 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  33.1 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  33.83 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  32.39 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  31.69 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  31.69 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  32.33 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  31.69 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  32.85 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  32.33 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  32.33 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  30.83 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>