32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3822 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  100 
 
 
140 aa  283  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  64.29 
 
 
140 aa  190  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  52.86 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  50.77 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  38.97 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  40.3 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  38.06 
 
 
142 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  39.26 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  38.35 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  36.15 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  37.12 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  36.84 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  37.5 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  37.5 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  36.76 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  39.26 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  37.4 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  39.42 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  37.5 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  38.24 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  36.76 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  36.76 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  34.09 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  37.5 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  36.03 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  35.29 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  35 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  32.33 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  35 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  34.29 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  34.29 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  33.57 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>