32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1773 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  100 
 
 
152 aa  317  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  64.03 
 
 
143 aa  192  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  62.09 
 
 
161 aa  189  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  64.93 
 
 
152 aa  187  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  60.13 
 
 
161 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  59.35 
 
 
159 aa  185  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  60.13 
 
 
161 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  59.87 
 
 
160 aa  185  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  60.78 
 
 
159 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  63.83 
 
 
157 aa  183  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  63.43 
 
 
152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  60.13 
 
 
159 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  59.48 
 
 
159 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  59.48 
 
 
159 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  58.17 
 
 
161 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  61.19 
 
 
152 aa  174  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  61.36 
 
 
156 aa  173  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  38.41 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  36.11 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  37.59 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  34.07 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  37.5 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  34.85 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  34.09 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  35.92 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  32.33 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  35.34 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  32.84 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  32.84 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  31.34 
 
 
141 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  30.6 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  31.34 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>