32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4895 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  100 
 
 
157 aa  333  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  91.82 
 
 
159 aa  306  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  86.34 
 
 
161 aa  293  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  86.34 
 
 
160 aa  290  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  91.19 
 
 
159 aa  283  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  91.82 
 
 
159 aa  283  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  91.19 
 
 
159 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  90.57 
 
 
159 aa  279  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  88.2 
 
 
161 aa  275  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  88.2 
 
 
161 aa  275  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  85.71 
 
 
161 aa  268  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  75.18 
 
 
152 aa  223  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  66.88 
 
 
152 aa  222  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  71.74 
 
 
156 aa  216  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  66.24 
 
 
152 aa  216  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  64.54 
 
 
152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  60.99 
 
 
143 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  39.72 
 
 
143 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  38.36 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  35.04 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  34.56 
 
 
134 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  38.24 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  38.36 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  36.5 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  32.17 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  31.11 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  34.75 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  30.08 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  29.32 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  27.82 
 
 
141 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  27.07 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  27.82 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>