32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4681 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  100 
 
 
159 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  88.82 
 
 
161 aa  304  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  91.61 
 
 
160 aa  298  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  92.45 
 
 
159 aa  292  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  91.3 
 
 
161 aa  290  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  91.82 
 
 
159 aa  288  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  91.19 
 
 
159 aa  286  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  91.82 
 
 
157 aa  285  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  90.57 
 
 
159 aa  283  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  88.82 
 
 
161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  88.2 
 
 
161 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  70.13 
 
 
152 aa  227  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  69.93 
 
 
152 aa  224  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  73.38 
 
 
156 aa  223  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  66.24 
 
 
152 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  59.35 
 
 
152 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  61.76 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  39.57 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  38.1 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  35 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  33.82 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  37.5 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  32.17 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  38.1 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  35.77 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  33.1 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  35.56 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  28.97 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  28.28 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  26.9 
 
 
141 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  27.59 
 
 
141 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  26.9 
 
 
141 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>