32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3173 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  100 
 
 
140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  61.43 
 
 
140 aa  187  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  56.12 
 
 
144 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  52.86 
 
 
140 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  42.22 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  38.58 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  42.22 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  40.6 
 
 
156 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  38.17 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  37.14 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  37.04 
 
 
152 aa  84  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  37.68 
 
 
143 aa  83.6  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  42.96 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  35.82 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  35.82 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  35.56 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  33.58 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  36.3 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  35.61 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  35.56 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  35.61 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  34.75 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  35.56 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  34.85 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  35.21 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  35.34 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  34.85 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  31.47 
 
 
141 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  30.07 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  31.47 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  30.07 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  31.47 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>