31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2854 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  100 
 
 
159 aa  338  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  98.74 
 
 
159 aa  333  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  98.11 
 
 
159 aa  332  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  90.57 
 
 
159 aa  305  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  96.86 
 
 
159 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  89.03 
 
 
160 aa  293  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  85.71 
 
 
161 aa  289  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  90.57 
 
 
157 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  89.44 
 
 
161 aa  279  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  86.34 
 
 
161 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  86.34 
 
 
161 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  67.32 
 
 
152 aa  220  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  68.28 
 
 
152 aa  215  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  62.82 
 
 
152 aa  208  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  70.07 
 
 
156 aa  206  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  60.13 
 
 
152 aa  184  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  61.76 
 
 
143 aa  183  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  38.73 
 
 
143 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  35.04 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  38.3 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  34.56 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  36.3 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  38.3 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  34.07 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  35.77 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  30 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  34.85 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  28.26 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  27.54 
 
 
141 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  26.09 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  25.36 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>