31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_C0009 on replicon NC_009787
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  100 
 
 
141 aa  297  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  97.87 
 
 
141 aa  291  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  95.74 
 
 
141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  94.33 
 
 
141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  91.49 
 
 
141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  39.39 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  34.56 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  36.76 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  33.57 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  35.21 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  40.91 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  34.29 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  33.58 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  30 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  31.34 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  32.35 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  36.17 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  30.88 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  30.28 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  32.33 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  32.84 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  29.08 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  28.28 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  32.41 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  28.26 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  28.17 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  28.26 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  28.17 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  28.37 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  28.36 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  28.17 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>