25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0047 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  100 
 
 		 141 aa  297  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  96.45 
 
 		 141 aa  286  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  95.04 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  95.74 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  91.49 
 
 		 141 aa  275  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  40.15 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  33.82 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  35.92 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  33.57 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  41.82 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  34.56 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  35 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  31.39 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  40.48 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  33.09 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  32.33 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  27.86 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  29.1 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  28.68 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  28.17 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  30.6 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  27.01 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  26.9 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  30.56 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  26.95 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0944493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>