32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0065 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  100 
 
 
141 aa  297  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  95.74 
 
 
141 aa  286  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  94.33 
 
 
141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  91.49 
 
 
141 aa  275  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  92.2 
 
 
141 aa  274  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  39.39 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  35.29 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  35 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  36.03 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  35.21 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  41.84 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  35 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  39.36 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0322633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  32.85 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  33.83 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  30 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  32.35 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  30.99 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  31.85 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  30.15 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  32.84 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  29.79 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  28.97 
 
 
159 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  32.41 
 
 
140 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  28.99 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  28.87 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  28.87 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  29.08 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  29.1 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  28.87 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  28.26 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  27.54 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0792821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>