36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4655 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  74.81 
 
 
135 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  74.05 
 
 
135 aa  189  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  77.05 
 
 
135 aa  189  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  67.69 
 
 
131 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  74.59 
 
 
127 aa  187  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  70.63 
 
 
131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  64.29 
 
 
130 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  73.44 
 
 
141 aa  166  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  60 
 
 
128 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  63.41 
 
 
131 aa  154  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  62.9 
 
 
155 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  62.9 
 
 
146 aa  154  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  62.9 
 
 
155 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  59.68 
 
 
128 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  56.8 
 
 
128 aa  147  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  57.26 
 
 
126 aa  144  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  61.29 
 
 
130 aa  139  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  54.89 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  54.03 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  54.03 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  51.22 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  53.66 
 
 
126 aa  123  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  50.41 
 
 
148 aa  123  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  48.78 
 
 
131 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  49.59 
 
 
125 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  53.33 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  48.82 
 
 
128 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  50.83 
 
 
129 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  47.62 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  46.77 
 
 
133 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  45.67 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  44.35 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  41.53 
 
 
546 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.94 
 
 
535 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  40.19 
 
 
579 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>