36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0783 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  62.3 
 
 		 126 aa  163  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  62.9 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  63.93 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  58.73 
 
 		 128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  57.94 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  59.5 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  62.6 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  49.66 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  50.71 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  50.71 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  55.56 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  56.35 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  54.76 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  55.37 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  54.03 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  52.85 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  52 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  52.8 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  51.2 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  54.4 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  51.52 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  52.85 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  48.76 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  47.93 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  49.6 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  47.2 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  45.9 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  51.22 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  38.4 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  39.47 
 
 		 546 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.78 
 
 		 535 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  41.82 
 
 		 579 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>