36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4055 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  266  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  79.69 
 
 		 131 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  78.46 
 
 		 130 aa  212  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  70.63 
 
 		 131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  68 
 
 		 127 aa  169  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  63.64 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  63.64 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  63.64 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  63.2 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  60.48 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  60 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  60.16 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  67.62 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  58.87 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  58.87 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  58.87 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  54.47 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  58.73 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  50.39 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  52.85 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  52.85 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  52.94 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  54.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  48.84 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  49.59 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  47.15 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  49.19 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  51.22 
 
 		 129 aa  120  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  46.83 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  47.97 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  47.97 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  39.09 
 
 		 546 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.39 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  38.18 
 
 		 579 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>