36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1162 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  273  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  93.13 
 
 
131 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  57.26 
 
 
128 aa  147  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  56.49 
 
 
131 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  57.85 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  51.24 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  50.41 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  50.41 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  48.36 
 
 
126 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  51.3 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  51.3 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  51.3 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  54.1 
 
 
130 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  50.41 
 
 
126 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  51.52 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  48.48 
 
 
131 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  49.17 
 
 
128 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  47.15 
 
 
131 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  48.78 
 
 
131 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  47.15 
 
 
130 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  46.15 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  49.59 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  51.22 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  49.59 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  47.93 
 
 
146 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  47.93 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  47.54 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  47.97 
 
 
135 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  47.97 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  47.97 
 
 
135 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  42.06 
 
 
148 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  49.5 
 
 
141 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  42.62 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  38.32 
 
 
546 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.75 
 
 
535 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  40 
 
 
579 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>