36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1353 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  273  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  93.13 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  54.84 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  56.2 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  53.44 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  55.74 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  52.27 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  51.24 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  50.41 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  53.04 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  53.04 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  53.04 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  50.41 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  49.59 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  52.27 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  48.36 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  51.22 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  49.59 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  48.76 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  46.92 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  47.97 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  52.03 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  48.76 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  48.76 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  49.59 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  47.54 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  49.59 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  49.59 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  49.59 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  51.49 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  40.98 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  38.74 
 
 		 546 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  40.91 
 
 		 579 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  32.46 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>