36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2234 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  260  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  66.67 
 
 
133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  56.56 
 
 
126 aa  143  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  50.41 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  51.24 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  50.81 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  52.46 
 
 
129 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  51.22 
 
 
128 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  52.03 
 
 
155 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  52.03 
 
 
146 aa  128  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  52.03 
 
 
155 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  50.41 
 
 
126 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  51.24 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  54.84 
 
 
135 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  54.03 
 
 
135 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  49.19 
 
 
131 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  54.03 
 
 
135 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  48.78 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  50.82 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  48.39 
 
 
131 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  48 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  48.82 
 
 
131 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  47.54 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  47.54 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  48.76 
 
 
131 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  48.36 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  46.77 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  48.82 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  52.42 
 
 
141 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  44.36 
 
 
138 aa  103  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  40.5 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  43.52 
 
 
546 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40 
 
 
535 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  38.89 
 
 
579 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>