36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03788 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  48.33 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  48.76 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  48.78 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  44.63 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  44.72 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  41.6 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  45.53 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  45.83 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  45.83 
 
 		 155 aa  94  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  45.83 
 
 		 155 aa  94  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  44.35 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  40.98 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  42.97 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  41.13 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  41.73 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  40.32 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  45.9 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  39.52 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  43.51 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  38.4 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  38.4 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  42.98 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  42.98 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  42.74 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  42.62 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  42.15 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  38.4 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  39.2 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  40.98 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  45.24 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  37.1 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  44.12 
 
 		 546 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.71 
 
 		 535 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  39.09 
 
 		 579 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>