36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0872 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  85.37 
 
 
126 aa  223  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  81.97 
 
 
128 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  79.51 
 
 
128 aa  206  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  77.69 
 
 
128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  68.42 
 
 
146 aa  186  7e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  68.42 
 
 
155 aa  186  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  68.42 
 
 
155 aa  186  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  62.9 
 
 
146 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  62.9 
 
 
128 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  60.77 
 
 
126 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  63.41 
 
 
131 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  59.35 
 
 
131 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  62.6 
 
 
130 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  60.16 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  60.16 
 
 
131 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  59.02 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  58.2 
 
 
135 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  58.2 
 
 
135 aa  141  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  53.49 
 
 
148 aa  140  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  57.02 
 
 
129 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  53.85 
 
 
129 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  51.24 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  54.55 
 
 
138 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  57.38 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  52.89 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  51.24 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  51.24 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  51.24 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  123  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  47.58 
 
 
128 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  56.86 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  40.98 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.71 
 
 
535 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  41.12 
 
 
546 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  42.59 
 
 
579 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>