41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0269 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  63.93 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  63.93 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  60.77 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  60 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  62.6 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  57.14 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  56.56 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  57.02 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  56.35 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  54.47 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  56.2 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  58.2 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  55.56 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  57.38 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  58.2 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  54.47 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  54.55 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  55.56 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  55.56 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  55.56 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  52.85 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  50.41 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  50.41 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  54.55 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  53.66 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  44.8 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  45.97 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  44 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  52.46 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  45.9 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  54.92 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  44.72 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.29 
 
 		 535 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  39.62 
 
 		 546 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  40 
 
 		 579 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1642  putative outer membrane protein  30.88 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1633  putative outer membrane protein  30.88 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1641  hypothetical protein  30.88 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1807  putative outer membrane protein  30.88 
 
 		 175 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0346895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1700  hypothetical protein  30.88 
 
 		 175 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0770687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>