36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0722 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  264  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  78.46 
 
 
131 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  79.69 
 
 
131 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  64.29 
 
 
131 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  66.14 
 
 
127 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  62.02 
 
 
135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  62.02 
 
 
135 aa  160  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  62.4 
 
 
128 aa  157  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  61.42 
 
 
135 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  60.8 
 
 
128 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  61.29 
 
 
126 aa  154  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  60.48 
 
 
146 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  60.48 
 
 
155 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  60.48 
 
 
155 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  60.16 
 
 
131 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  63.49 
 
 
141 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  60.32 
 
 
128 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  55.56 
 
 
146 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  55.56 
 
 
128 aa  139  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  56 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  54.47 
 
 
126 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  50.81 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  52.99 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  50.79 
 
 
133 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  47.15 
 
 
131 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  47.97 
 
 
131 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  47.62 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  47.33 
 
 
131 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  49.59 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  49.6 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  47.62 
 
 
128 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  47.54 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  40.32 
 
 
131 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.09 
 
 
535 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  39.66 
 
 
546 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  39.02 
 
 
579 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>