36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3714 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3714  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  270  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.387617  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2234  hypothetical protein  66.67 
 
 
128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0269  hypothetical protein  57.02 
 
 
126 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106589  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0783  hypothetical protein  55.37 
 
 
146 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0926  hypothetical protein  55.37 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0654  hypothetical protein  54.84 
 
 
127 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0902  hypothetical protein  52.07 
 
 
126 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00879275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0872  hypothetical protein  52.89 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.797688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1126  hypothetical protein  52.31 
 
 
135 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0455232  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  53.17 
 
 
135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3474  hypothetical protein  49.59 
 
 
128 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3318  hypothetical protein  47.97 
 
 
128 aa  123  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4552  hypothetical protein  49.59 
 
 
129 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362228  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0722  hypothetical protein  50.79 
 
 
130 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  52.38 
 
 
135 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1353  hypothetical protein  46.92 
 
 
131 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1162  hypothetical protein  46.15 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0845  hypothetical protein  51.24 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1058  hypothetical protein  47.11 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4055  hypothetical protein  46.83 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1648  hypothetical protein  50.41 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0644995  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03788  hypothetical protein  48.33 
 
 
131 aa  117  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1653  hypothetical protein  46.03 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0864916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3027  hypothetical protein  48.12 
 
 
138 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0927  hypothetical protein  47.93 
 
 
128 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1374  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0771  hypothetical protein  48.36 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0529707  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3454  hypothetical protein  49.14 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5237  hypothetical protein  46.83 
 
 
131 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147889  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3333  hypothetical protein  49.14 
 
 
155 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3195  hypothetical protein  49.14 
 
 
155 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4655  hypothetical protein  46.77 
 
 
131 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0800268  normal  0.362221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2142  hypothetical protein  51.43 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.011692  normal  0.140922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  39.29 
 
 
546 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.7 
 
 
535 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  36.67 
 
 
579 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>