36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4094 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  208  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  65.09 
 
 
107 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  61.9 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  69.52 
 
 
105 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  65.09 
 
 
107 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  61.32 
 
 
107 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  63.21 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  60 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  58.1 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  58.1 
 
 
106 aa  120  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  63.81 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  53.77 
 
 
105 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  64.15 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  59.05 
 
 
107 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  55.56 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  54.37 
 
 
104 aa  103  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  51.92 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  50 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  62.79 
 
 
304 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  51.46 
 
 
104 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  54.84 
 
 
107 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  52.43 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  50.96 
 
 
106 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  50.96 
 
 
106 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  57.69 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  51.46 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  44.44 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  38.1 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  36.7 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  41.33 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  34.48 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  37.14 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  32.35 
 
 
122 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>