36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1033 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  214  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  58.1 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  61.9 
 
 
105 aa  122  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  56.6 
 
 
106 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  57.14 
 
 
106 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  54.81 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  55.24 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  55.24 
 
 
107 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  53.27 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  53.4 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  51.46 
 
 
107 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  53.33 
 
 
107 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  53.27 
 
 
104 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  54.81 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  51.43 
 
 
107 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  55.34 
 
 
105 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  54.72 
 
 
104 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  63.1 
 
 
304 aa  104  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  50.48 
 
 
107 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  51.89 
 
 
104 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  58.44 
 
 
105 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  47.17 
 
 
106 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  47.17 
 
 
106 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  47.66 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  53.33 
 
 
107 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  41.35 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  52.88 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  40.43 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  39.33 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  31.68 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  30.28 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  30.11 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  27.85 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  28.75 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  30.53 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  35.58 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>