36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1282 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  61.9 
 
 
105 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  61.9 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  61.9 
 
 
107 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  56.19 
 
 
106 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  56.6 
 
 
107 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  58.1 
 
 
106 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  55.77 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  59.81 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  54.81 
 
 
131 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  51.43 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  52.38 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  61.9 
 
 
304 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  51.43 
 
 
107 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  50.94 
 
 
106 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  50.94 
 
 
104 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  54.72 
 
 
104 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  49.06 
 
 
106 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  49.06 
 
 
106 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  57.69 
 
 
104 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  47.47 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  48.57 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  53.76 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  48.98 
 
 
105 aa  91.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  50.48 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  44.57 
 
 
107 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  44.23 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  45.56 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  37.38 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  35.96 
 
 
113 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  34.29 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  38.82 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  34.38 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  32.58 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  37.97 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  47.83 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>