37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3594 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  55.45 
 
 
113 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  52.68 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  50.89 
 
 
115 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  40.95 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  40.57 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  43.93 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  41.18 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  43.69 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  38.61 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  34.58 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  41.3 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  39.36 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  38.68 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  35.58 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  38.83 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  35.51 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  38.71 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  38.38 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  37.14 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  41.33 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  36.56 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  36.45 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  40.96 
 
 
304 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  35.24 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  34.48 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  35.19 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  35.35 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  35.35 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  40.86 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  33.01 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  33.02 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  37.33 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0572  hypothetical protein  37 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.172357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  31.71 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  34.29 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1707  hypothetical protein  27.78 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>