35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0843 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  204  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  88.79 
 
 
107 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  97.67 
 
 
304 aa  163  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  60.95 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  61.9 
 
 
106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  63.81 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  60.95 
 
 
131 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  63.81 
 
 
105 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  55.24 
 
 
107 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  59.05 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  59.05 
 
 
106 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  59.05 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  59.26 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  54.37 
 
 
107 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  72.15 
 
 
104 aa  105  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  58.65 
 
 
107 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  63.21 
 
 
104 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  54.81 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  56.31 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  50.96 
 
 
105 aa  97.1  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  56.19 
 
 
107 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  53.85 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  53.85 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  55.91 
 
 
105 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  52.88 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  55.77 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  48.89 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  47.31 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  41.94 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  39.51 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  36.56 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  37.8 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  36.08 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  35.45 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  41.43 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>