38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3720 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  85.05 
 
 		 107 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  80.19 
 
 		 107 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  71.43 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  84.91 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  70.48 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  65.09 
 
 		 106 aa  139  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  68.87 
 
 		 106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  57.01 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  53.33 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  51.43 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  54.37 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  54.37 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  56.31 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  52.43 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  53.4 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  54.35 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  50.51 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  53 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  59.76 
 
 		 304 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  49.51 
 
 		 106 aa  94  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  49.51 
 
 		 106 aa  94  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  43.93 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  52.43 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  47.12 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  44.23 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  43.75 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  41.41 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  34.86 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  38.83 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  31.43 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  40.28 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  31.03 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  30.69 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  41.82 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1707  hypothetical protein  29.55 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0572  hypothetical protein  30.23 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.172357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>