32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3123 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  49.52 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  49.52 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  47.87 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  45.26 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  46.6 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  46.81 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  42.45 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  45.71 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  53.95 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  44.68 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  41.9 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  42.31 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  50.65 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  50.65 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  39.36 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  40.78 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  44.76 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  45.65 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  49.35 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  40.86 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  36.27 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  36.19 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  46.53 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  34.74 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  42.86 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  31.03 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  44.23 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.613467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>