36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2546 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  207  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  68.93 
 
 
104 aa  143  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  66.99 
 
 
106 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  67.96 
 
 
106 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  65.38 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  65.38 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  58.65 
 
 
104 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  60.38 
 
 
105 aa  115  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  59.62 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  58.25 
 
 
107 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  51.43 
 
 
107 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  58.82 
 
 
131 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  55.91 
 
 
105 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  54.72 
 
 
107 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  65.93 
 
 
107 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  55.66 
 
 
107 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  72.15 
 
 
107 aa  105  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  52.38 
 
 
108 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  50.94 
 
 
106 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  71.79 
 
 
304 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  56.31 
 
 
107 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  53.4 
 
 
105 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  65.82 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  51.46 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  63.74 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  62.82 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  41.75 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  40.59 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  43.96 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  36.59 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  36.36 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  34.67 
 
 
113 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  32.69 
 
 
115 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  40 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3707  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32.88 
 
 
392 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0529764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>