36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0416 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  225  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  93.04 
 
 
115 aa  207  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  57.66 
 
 
113 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  52.68 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  35.24 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  35.24 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  42.86 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  40.59 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  38.1 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  38.78 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  38.46 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  33.98 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  36.19 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  35.45 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  45.24 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  35.24 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  38.83 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  44.05 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  34.74 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  34.29 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  33.33 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  34.29 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  36.08 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  39.33 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0572  hypothetical protein  39.18 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.172357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  31.78 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  34.91 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  34.91 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  30.28 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  35.8 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1707  hypothetical protein  31.87 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  35.05 
 
 
304 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  32.43 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  35.96 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  32.69 
 
 
104 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  32.69 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>