37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1583 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  82.08 
 
 		 107 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  80.19 
 
 		 107 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  71.43 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  68.87 
 
 		 108 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  82.24 
 
 		 107 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  68.87 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  61.32 
 
 		 106 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  59.05 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  54.72 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  59.05 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  57.28 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  58.25 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  51.43 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  55.24 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  64.63 
 
 		 304 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  53.76 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  61.84 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  53.4 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  60.26 
 
 		 105 aa  93.6  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  49.53 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  49.53 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  46.23 
 
 		 107 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  46.15 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  47.12 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  41 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  35.24 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  33.94 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  34.29 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  32.91 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  31.25 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  35.24 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0572  hypothetical protein  29.9 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.172357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2394  hypothetical protein  34 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>