35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1466 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1466  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2862  hypothetical protein  61 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0900552  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0710  hypothetical protein  62.37 
 
 		 106 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2125  hypothetical protein  60.22 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0800  hypothetical protein  60.22 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1075  protein of unknown function DUF1476  57.89 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2546  hypothetical protein  55.91 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43721  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5410  hypothetical protein  58.33 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4094  hypothetical protein  51.92 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2590  hypothetical protein  56.25 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254891  normal  0.154135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1033  hypothetical protein  58.44 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.118676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4710  hypothetical protein  61.84 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2381  hypothetical protein  50.96 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1746  hypothetical protein  56.12 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3442  hypothetical protein  53.12 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0843  hypothetical protein  50.96 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3720  hypothetical protein  53 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1303  hypothetical protein  61.33 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0355  hypothetical protein  60.53 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1583  hypothetical protein  60.26 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2521  hypothetical protein  60.53 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.453827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1282  hypothetical protein  48.98 
 
 		 106 aa  91.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0835  HpcH/HpaI aldolase  59.21 
 
 		 304 aa  88.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1632  hypothetical protein  57.33 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4348  protein of unknown function DUF1476  52.43 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1178  protein of unknown function DUF1476  43.4 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3123  hypothetical protein  53.95 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0714  hypothetical protein  46.67 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1497  hypothetical protein  47.17 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.107399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7066  protein of unknown function DUF1476  38.55 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.769314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6239  hypothetical protein  41.82 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.613467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0416  hypothetical protein  35.8 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.883077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2605  hypothetical protein  36.25 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0251108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3594  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581607  normal  0.055135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>